ADN libre circulante
El ADN libre circulante (cfDNA) (también conocido como ADN libre de células) son fragmentos de ADN degradados liberados a los fluidos corporales como el plasma sanguíneo, la orina, el líquido cefalorraquídeo, etc. Los tamaños típicos de los fragmentos de cfDNA reflejan también las partículas de cromatosoma (~165 pb). como múltiples nucleosomas, que protegen el ADN de la digestión por nucleasas apoptóticas.[1] El término cfDNA se puede utilizar para describir diversas formas de ADN que circulan libremente en los fluidos corporales, incluido el ADN tumoral circulante (ctDNA), el ADN mitocondrial libre de células (ccf mtDNA), el ADN fetal libre de células (cffDNA) y el ADN celular derivado de un donante. ADN libre (dd-cfDNA).[2] Se observan niveles elevados de cfDNA en el cáncer, especialmente en la enfermedad avanzada.[3] Hay evidencia de que el cfDNA se vuelve cada vez más frecuente en circulación con el inicio de la edad.[4] Se ha demostrado que el cfDNA es un biomarcador útil para multitud de dolencias además del cáncer y la medicina fetal. Esto incluye, entre otros, traumatismos, sepsis, inflamación aséptica, infarto de miocardio, accidente cerebrovascular, trasplantes, diabetes y anemia de células falciformes.[5] El cfDNA es principalmente una molécula extracelular de ADN de doble hebra, que consta de pequeños fragmentos (50 a 200 pb) [6][7] y fragmentos más grandes (21 kb) [8] y ha sido reconocido como un marcador preciso para el diagnóstico de cáncer de próstata y cáncer de mama.[9]
Estudios recientes han sentado las bases para inferir la expresión génica a partir de ADN libre de células, y EPIC-seq emerge como un avance notable.[10] Este método ha elevado sustancialmente el nivel de la inferencia no invasiva de los niveles de expresión de genes individuales, aumentando así la aplicabilidad del ensayo en la caracterización de enfermedades, la clasificación histológica y el seguimiento de la eficacia del tratamiento.[10][11][12]
Otras publicaciones confirman el origen del cfDNA de carcinomas y el cfDNA ocurre en pacientes con cáncer avanzado. El ADN libre de células (cfDNA) está presente en el plasma circulante y en otros fluidos corporales.[13]
La liberación de cfDNA al torrente sanguíneo aparece por diferentes motivos, entre ellos la apoptosis, la necrosis y la NETosis. Su acumulación rápidamente aumentada en la sangre durante el desarrollo del tumor es causada por una liberación excesiva de ADN por parte de las células apoptóticas y las células necróticas. Se ha discutido la secreción activa dentro de los exosomas, pero aún se desconoce si se trata de una fuente relevante o relativamente menor de cfDNA.[14]
El cfDNA circula predominantemente como nucleosomas, que son complejos nucleares de histonas y ADN.[15] El cfDNA también se puede observar en rangos de tamaño más cortos (por ejemplo, 50 pb) y asociado con elementos reguladores. [16] Con frecuencia están elevados de manera no específica en el cáncer, pero pueden ser más específicos para monitorear la terapia citotóxica contra el cáncer, principalmente para la estimación temprana de la eficacia de la terapia.